楽天市場の店舗がAPIで自動連携されており、かつ、APIで自動取込された受注伝票の場合、自動的にステータスが連動します。
受注伝票の入金ステータスに「注文確認待ち」「楽天処理中」と表示されている場合、まだRMS側で「発送待ち」ステータスに移動していない（決済処理が完了していない）ため、「入金待ち」ステータスが維持されます。
注意
「注文確認待ち」の場合で、かつLOGILESSまたはRMSで自動注文確認を適用していない場合、RMSで注文確認処理が必要です。詳細はこちらのドキュメントをご確認ください。
ヒント
RMSで「発送待ち」になってからLOGILESSにステータスが反映されるまで30分程度かかることがあります。