出荷指示書にオペレーター側で設定した商品マスタの補足情報を印字することはできますか？

はい、オペレーター側の商品マスタで「出荷属性」の「コメント」を設定することで、出荷指示書に商品マスタの補足情報を印字することができます。

出荷指示書の商品名の下に、出荷属性のコメントが印字されます。